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Galaxy
Anmeldungsdatum: 18.11.2015 Beiträge: 2
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Verfasst am: 18. Nov 2015 21:52 Titel: Leseraster in der mRNA und das Startcodon? |
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Guten Abend,
letztens im Biologieunterricht verursachte eine Aufgabe in der ganzen Klasse Verwirrung. Und zwar haben wir eine mRNA-Basensequenz die wie folgt lautet:
5' GACCGAUGACUGGGCGAAGAAGAUAG 3' mit dem Startcodon AUG.
Die erste Aufgabe lautete, die Aminosäuren zu bestimmen, die von diesem Abschnitt codiert werden. Kein Problem dachte ich mir, einfach ab dem Startcodon AUG eine Einteilung in Dreierschritte machen und dann auf die Codesonne schauen.
Die nächste Aufgabe lautete jedoch die erste Base nach dem Start wegfallen zu lassen. Hierbei habe ich einfach das A nach AUG entfernt und bekam neue Aminosäuren. Das Lösungsbuch sah jedoch vor, die erste Base des gesamten Stranges (G) zu entfernen, was eine Verschiebung der Dreier-Einteilung verursachen würde und somit kein Startcodon mehr vorhanden wäre.
Doch dies erschließt sich mir nicht ganz, bisher dachte ich immer die Dreier-Einteilung beginnt sowieso erst ab dem Startcodon AUG, egal welche Basen sich davor befinden, anders hätte auch die vorherige Aufgabe zu keinem Ergebnis geführt.
Daher meine Frage:
Beginnt die Einteilung in Basentripletts bereits an dem 5'-Ende des Stranges oder erst ab dem Startcodon AUG?
Wenn es nur eins von beiden ist, würden sich die beiden Aufgaben ja widersprechen.
Entschuldigung für die lange Frage und vielen Dank im Voraus. |
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Firelion
Anmeldungsdatum: 27.08.2009 Beiträge: 1878
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Verfasst am: 18. Nov 2015 22:24 Titel: |
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Hi,
es beginnt schon mit dem Startcodon, da dieses für die Aminosäure Methionin steht. Dein Lösungsbuch meinte dann wahrscheinlich die erste Base des gesamten Stranges.
LG, Firelion _________________ It is well known that a vital ingredient of success is not knowing that what you’re attempting can’t be done - Terry Pratchett |
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Galaxy
Anmeldungsdatum: 18.11.2015 Beiträge: 2
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Verfasst am: 18. Nov 2015 22:50 Titel: |
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Ja, genau das habe ich ja geschrieben. Nur laut dem Lösungsbuch wird durch das Entfernen der ersten Base die gesamte Dreier-Einteilung verschoben, und somit befindet sich AUG nicht mehr in einem Triplett.
Nur meines Wissens nach sollte das Ändern der Basen vor dem Startcodon die Dreier-Einteilung gar nicht beeinflussen, da diese immer bei AUG beginnt.
Oder irre ich mich da? |
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Firelion
Anmeldungsdatum: 27.08.2009 Beiträge: 1878
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Verfasst am: 18. Nov 2015 23:09 Titel: |
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Wenn eine Mutation dazu führt, dass es kein Startcodon mehr gibt, führt es dazu dass kein Protein synthetisiert wird.
Würde das G hier nur durch A, U oder C ersetzt werrden, könnte es sein, dass es folgenlos bleibt. Der Verlust verschiebt aber das Leseraster und fgührt in doesem Beispiel zum Verlust des Startcodons.
Du meintest den Start der translatierten Sequenz. Die Aufgabe zielt hier aber auf den Anfang der angegeben (gesamten) Sequenz. _________________ It is well known that a vital ingredient of success is not knowing that what you’re attempting can’t be done - Terry Pratchett |
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jörg
Anmeldungsdatum: 12.12.2010 Beiträge: 2107 Wohnort: Bückeburg
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Verfasst am: 20. Nov 2015 15:41 Titel: |
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Ich verstehe nicht, was du meinst, Firelion. Der Leserahmen beginnt doch erst mit dem Startcodon, das Leseraster ist hier doch völlig egal, da ich es dem Startcodon anpassen würde.
Oder mißverstehe ich da etwas?
Auch bei der originalen Sequenz liegt das Startkodon nicht in demjenigen Leseraster, das die genannte Sequenz mit einem Triplet beginnen lässt, was nach meiner Ansicht aber auch völlig egal ist. Wie gesagt, das Leseraster würde ich hier einem sinnvollen Leserahmen anpassen.
Das Leseraster wäre also:
GA-CCG-AUG-ACU-GGG-CGA-AGA-AGA-UAG
Dabei wäre der Leserahmen
AUG-ACU-GGG-CGA-AGA-AGA-UAG
(Start- und Stoppcodon sind fett markiert). In jedem anderen Leseraster hätte ich keinen Translationsstart...
Andere mögliche Leseraster:
G-ACC-GAU-GAC-UGG-GCG-AAG-AAG-AUA-G
oder
GAC-CGA-UGA-CUG-GGC-GAA-GAA-GAU-AG
Wenn ich nun die erste Base des gesamten Stranges entferne, bleibt als einziges sinnvolles Leseraster immer noch dasjenige, welches den Leserahmen erhält:
A-CCG-AUG-ACU-GGG-CGA-AGA-AGA-UAG _________________ RNA?- just another nucleic acid? |
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Firelion
Anmeldungsdatum: 27.08.2009 Beiträge: 1878
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Verfasst am: 20. Nov 2015 21:45 Titel: |
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Hupps sorry
Du hast natürlich Recht. Ich hatte nicht daran gedacht, dass es nicht mit der ersten Base beginnen muss. Ich bin wohl etwas eingerostet was Genetik betrifft.
LG[[/img] _________________ It is well known that a vital ingredient of success is not knowing that what you’re attempting can’t be done - Terry Pratchett |
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jörg
Anmeldungsdatum: 12.12.2010 Beiträge: 2107 Wohnort: Bückeburg
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Verfasst am: 21. Nov 2015 00:50 Titel: |
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Na gut, dann sind wir uns ja einig....
Um also damit nochmal auf die Ausgangsfragestellung zurückzukehren:
Wenn dein Lösungsbuch wirklich das behauptet, was du hier geschrieben hast, Galaxy, dann wirf es weg.
Da steht:
Galaxy hat Folgendes geschrieben: | Das Lösungsbuch sah jedoch vor, die erste Base des gesamten Stranges (G) zu entfernen, was eine Verschiebung der Dreier-Einteilung verursachen würde und somit kein Startcodon mehr vorhanden wäre. |
Das ist natürlich quatsch, das Leseraster kannst du in drei verschiedenen Anordnungen schreiben, von denen nur eine einen sinnvollen Leserahmen ergibt, nämlich die o.g.
GA-CCG-AUG-ACU-GGG-CGA-AGA-AGA-UAG
Bei allen anderen würden gar keine Aminosäuren aneinandergeknüpft werden.
Dieser Leserahmen bleibt nun der einzige sinnvolle, ob du die erste Base des Stranges entfernst oder nicht ist dabei völlig egal.
Etwas anderes wäre es, wenn du aus dem Leserahmen eine Base entferntest.
Dann würde sich der Leserahmen verschieben und es würde kein Stoppcodon mehr geben. Womöglich soll das die Lösung sein, ich weiß es aber nicht genau.
Beispielhaft habe ich einmal einen beliebige Base aus dem Leserahmen entfernt:
AUG-AUG-GGC-GAA-GAA-GAU-AG
Das Stoppcodon ist weg, jedoch hättest du hier zwei Startkodons. An beiden könnte das Ribosom letztendlich mit der Translation beginnen.
Um das Startcodon loszuwerden musst du eine Base aus dem Startcodon entfernen. _________________ RNA?- just another nucleic acid? |
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