DNA-Transkription, Promotor

ecuador11 · Anmeldungsdatum: 05.03.2011 Beiträge: 1

Meine Frage:
Hallo!! ich habe eine Frage zu den Promotoren in der DNA und zu der Leserichtung und Herausfinden des codogenen Stranges.
Also ich habe einen DNA-Strang und es ist ein Promotor markiert.
Die erste Frage ist liegt der Promotor nur auf einem Strang oder gehört die Sequenz des de komplementären Strangs auch dazu?

Meine Ideen:
Ich gehe jetzt einmal davon aus, dass die Sequenzen beider sich gegenüber liegenden Stränge den Promotor bilden. Wenn das so ist, wie finde ich heraus, welcher der Stränge der codogene Strang für das Gen ist? Es kann ja theoretisch nach links oder nach rechts in 3'-5' Richtung gehen, also entweder der obere Strang oder der untere.
Weiß also zufällig jemand, wie ich herrausfinde ob ich mir die Stränge nach rechts oder nach links verlaufend anschauen muss?
Danke schön schon mal!

jörg · Anmeldungsdatum: 12.12.2010 Beiträge: 2107 Wohnort: Bückeburg

Das kommt ganz auf den Promotor an, es gibt sowohl bidirektionale (beide "Richtungen") als auch monodirektionale (nur eine "Richtung") Promoter.

In der Regel "erkennen" die an die Promotorsequenz bindenden Faktoren diese, obwohl sie als Doppelstrang vorliegt (also quasi "von aussen").
In welche Richtung dann "gelesen" werden soll, wird durch die "Polarität" der Promotordomänen (es existiert quasi ein "vorne" und ein "hinten") vorgegeben. Dabei spielt die Bindung von sog. Initiationsfaktoren eine Rolle, die die Bindung der DNA- abhängigen RNA- Polymerasen "erleichtert" (bzw. auch "erschweren" kann).
Es konnte aber gezeigt werden, dass nicht alle dieser Initiationsfaktoren absolut notwendig sind, die Polymerase kann auch direkt an die Transkriptionsfaktoren binden. Durch die Seite der Bindung und die Ausrichtung der Polymerase wird dann die Transkriptionsrichtung vorgegeben.
Auch werden promotorspezifische Sequenzen teilweise von der Polymerase direkt erkannt, was Anteil an der Ausrichtung derselben haben kann.
Seltsamerweise gibt es aber auch Situationen, in denen die Polymerase zwar bindet, aber die Transkription dennoch nicht "gestartet" wird.