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globgene
Anmeldungsdatum: 04.01.2012
Beiträge: 27
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 Verfasst am: 04. Jan 2012 21:19 Titel: Insulator |
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In meinem Genetikunterlagen ist die Rede von Insulator-Elementen, "diese trennen Bereiche unterschiedlicher Transkriptionsaktivität auf Chromosomen".
Aus was genau ist dieser Insulator aufgebaut ?
Ich vermute, dass der Insulator eine Bezeichnung für ein an eine isolatorstelle-gebundenes isolator-Protein ist - liege ich damit richtig ? |
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jörg
Anmeldungsdatum: 12.12.2010
Beiträge: 2107
Wohnort: Bückeburg
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| Verfasst am: 05. Jan 2012 10:10 Titel: |
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Isolatoren sind DNA-Elemente. Sie können z.B. zwischen einem Enhancer und einem Promoter liegen und damit die Wirkung des Enhancers auf den Promoter inhibieren/blockieren. Das gewährleistet z.B., dass ein Enhancer, der sonst auf mehrere Promotoren wirkte, auf den durch den Isolator abgetrennten nicht wirkt. Es handelt sich also um ein regulatorisches Element.
Andere Isolatoren können auch Gene vor Expressionsrepression schützen. Liegt z.B. ein Gen benachbart zum nicht transkribierten Heterochromatin, würde es durch die Heterochromatinstruktur eine Expressionshemmung/-repression erfahren. Damit dies nicht geschieht, kann ein Isolator diese Hemmung/Repression aufheben und das Gen kann "normal" transkribiert werden.
Den Begriff "Insulator" kenne ich nur aus dem englischen, da wird er synonym zu dem deutschsprachigen Begriff des Isolators verwendet. Zwar werden die Sequenzen über DNA-bindende Proteine erkannt, jedoch wüsste ich nicht, dass diese Proteine (soweit bekannt) eine homogene, als Gruppe zu bezeichnenede Nomenklatur aufweisen.
Kurz: Es sind DNA-Elemente, also Sequenzen, die aber auch nicht homogen sind. Es gibt aber einige konservierte Motive innerhalb dieser Sequenzen.
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RNA?- just another nucleic acid? |
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globgene
Anmeldungsdatum: 04.01.2012
Beiträge: 27
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| Verfasst am: 05. Jan 2012 11:10 Titel: |
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Wie kann man sich diese Verhinderung der Interaktion zwischen Enhancer und Promotor genau vorstellen ?
Verhindert der Insulator/ Isolator dass sich die DNA-Fäden biegen und der Enhancer in die Nähe des Promotors kommt ? Wenn ja - wie genau macht er das ?
Du schreibst, dass auch die Eigenschaft, naheliegene aktive Gene auszuschalten, von Heterochromatin, durch Isolatoren verhindert werden kann? Wie genau funktioniert das ? Wird das Heterochromatin fixiert?
Zusätzlich habe ich gehört das die Isolatoren auch die Hauptrolle bei der Kompartimentierung spielen. Werden da nur Chromosomen als ganzes in bestimmte Terretorien verlagert oder auch einzelne DNA-Stücke eines Chromosoms + einzelne DNA-Stücke eines anderen Chromosoms ? |
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jörg
Anmeldungsdatum: 12.12.2010
Beiträge: 2107
Wohnort: Bückeburg
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| Verfasst am: 05. Jan 2012 12:55 Titel: |
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| globgene hat Folgendes geschrieben: | | Wie kann man sich diese Verhinderung der Interaktion zwischen Enhancer und Promotor genau vorstellen ? |
Da bin ich leider überfragt. Einige Insulator-bindende Proteine interagieren mit Deacetylasen und wirken hierüber auf das epigenetische Muster. Ein Modell schlägt auch vor, dass der Insulator proteinvermittelt eine "Schleife" zum Promoter bildet.
Ferner konnte gezeigt werden, dass Insulatoren das Acetylierungs- und Methylierungsmuster beeinflussen, also "Promoter-silencing" über epigenetische Faktoren wäre da ein Stichwort.
Wie das allerdings mechanistisch abläuft, kann ich dir leider nicht sagen.
Hast du schon mal bei pubmed geschaut?
| globgene hat Folgendes geschrieben: | | Werden da nur Chromosomen als ganzes in bestimmte Terretorien verlagert oder auch einzelne DNA-Stücke eines Chromosoms + einzelne DNA-Stücke eines anderen Chromosoms ? |
Die territoriale Einteilung gilt eigentlich nur für das entsprechende Chromosom. Hier wird der Übergang von Hetero- zu Euchromatin "markiert".
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globgene
Anmeldungsdatum: 04.01.2012
Beiträge: 27
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| Verfasst am: 05. Jan 2012 18:13 Titel: |
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| jörg hat Folgendes geschrieben: | ...
Wie das allerdings mechanistisch abläuft, kann ich dir leider nicht sagen.
Hast du schon mal bei pubmed geschaut?..
dass Insulatoren das Acetylierungs- und Methylierungsmuster beeinflussen, also "Promoter-silencing".. |
Habe eine Grafik aus Nature vor mir liegen wo gezeigt wird das der Insulator mit einer benachbarten Kette verbunden ist und dadurch die Schleifenbildung verhindert wird, die es dem Enhancer erlauben würde in die Nähe des Promotors zu kommen. Glaube aber das dies auch nur eine Theorie bzw. eine von vielen Möglichkeiten ist.
Zur epigenetischen Manipulation:
Dann wäre der Insulator wieder ein Proteinkomplex der dann alles andere ermöglicht. Also sozusagen ein "Promotor für das gene-silencing". |
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jörg
Anmeldungsdatum: 12.12.2010
Beiträge: 2107
Wohnort: Bückeburg
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| Verfasst am: 05. Jan 2012 18:40 Titel: |
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| globgene hat Folgendes geschrieben: |
Habe eine Grafik aus Nature vor mir liegen wo gezeigt wird das der Insulator mit einer benachbarten Kette verbunden ist und dadurch die Schleifenbildung verhindert wird, die es dem Enhancer erlauben würde in die Nähe des Promotors zu kommen. |
Kannst du mir den Titel der Publikation nennen? Täte mich nämlich auch interessieren.
| globgene hat Folgendes geschrieben: | Zur epigenetischen Manipulation:
Dann wäre der Insulator wieder ein Proteinkomplex der dann alles andere ermöglicht. Also sozusagen ein "Promotor für das gene-silencing". |
Der Begriff Promoter ist hier fehl am Platze, auch legt ein Insulator nicht unbedingt Gene still, er kann auch heterochromatinbedingtes Silencing inhibieren, wäre damit also ein Aktivator.
Das sind zwei verschiedene Typen von Isolatoren (1: Silencing über Inhibition der Promoter-Enhancer-Wechselwirkung; 2: Inhibition der Heterochromatin-Promoter-Wechselwirkung und damit indirekt Aktivierung).
Ich habe auch noch einmal nachgeschaut, als Insulator wird in einiger Literatur auch durchaus das Protein/der Proteinkomplex bezeichnet, der das DNA-Motiv des Isolators erkennt. Die Nomenklatur geht da manchmal durcheinander.
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globgene
Anmeldungsdatum: 04.01.2012
Beiträge: 27
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| Verfasst am: 05. Jan 2012 19:23 Titel: |
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| jörg hat Folgendes geschrieben: |
Kannst du mir den Titel der Publikation nennen? Täte mich nämlich auch interessieren. |
Hier gleich direkt der Link:
http://www.nature.com/nsmb/journal/v8/n3/fig_tab/nsb0301_192_F2.html
| jörg hat Folgendes geschrieben: |
Ich habe auch noch einmal nachgeschaut, als Insulator wird in einiger Literatur auch durchaus das Protein/der Proteinkomplex bezeichnet, der das DNA-Motiv des Isolators erkennt. |
Ja, so finde ich das auch in meinen Unterlagen vor ! |
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jörg
Anmeldungsdatum: 12.12.2010
Beiträge: 2107
Wohnort: Bückeburg
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| Verfasst am: 05. Jan 2012 22:48 Titel: |
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Schönen Dank.
Ist schon spannend, ich werde mir morgen gleich mal den Artikel besorgen, hast mich jetzt neugierig gemacht...
Grüsse Jörg
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globgene
Anmeldungsdatum: 04.01.2012
Beiträge: 27
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| Verfasst am: 05. Jan 2012 22:49 Titel: |
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| jörg hat Folgendes geschrieben: | Schönen Dank.
Ist schon spannend, ich werde mir morgen gleich mal den Artikel besorgen, hast mich jetzt neugierig gemacht...
Grüsse Jörg |
Das hört man gerne 
Lass es mich wissen wenn du was neues rausfindest ! |
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