transkriptome

erik34 · Gast

Meine Frage:
hallo!
ich muss ein paper lesen das heißt next-generation transcriptome assembly. das problem ist das es auf englisch ist und ich nicht viel verstehe. habs nämlich schon gelesen aber eben kaum was verstanden. hat vllt einer von euch das paper gelesen und kann mir sagen worum es geht? ich wäre euch echt dankbar! bin nämlich schon verzweifelt. und was heißt transcriptome assembly?

Meine Ideen:
danke schon mal!!!

Karon · Organisator Anmeldungsdatum: 06.11.2004 Beiträge: 2344 Wohnort: Hessen

Was ein Transkriptom ist, weißt du?
http://de.wikipedia.org/wiki/Transkriptom

Ich nehme an, dass es darum geht, wie man ein komplettes Transkriptom erstellen kann, obwohl man immer nur Teile davon untersuchen kann und nicht immer ein Referenzgenom hat.

"Transcriptome assembly" wäre also einfach die "Zusammensetzung des Transkriptoms". Zwinkern

Kenne mich damit aber nicht wirklich aus, hab das einfach mal aus dem kurzen Abstract geschlossen, dass ich hier gefunden habe: http://www.nature.com/nrg/journal/v12/n10/full/nrg3068.html

erik34 · Gast

also das transkriptom ist ja eigentlich nur die gesamte mrna. und ich hab hier mal den link zum paper ohio.edu/bioinformatics/upload/next-generation-transcriptome-assembly.pdf

könntest du mir vllt bei der ersten seite helfen? bin da schon irgendwie überfordert...was genau ist RNA-seq?

Karon · Organisator Anmeldungsdatum: 06.11.2004 Beiträge: 2344 Wohnort: Hessen

Das ist genau das von mir verlinkte Paper...

Was RNA-seq ist, steht doch gleich im ersten Absatz (10./11. Zeile). Hast du das Paper wirklich gelesen?!? grübelnd

Für was brauchst du das überhaupt? Schule? Uni?