RNA-Schalter / Riboswitch

JonomcFlono · Anmeldungsdatum: 28.01.2011 Beiträge: 99

Hallo,

was genau ist der Unterschied zwischen einem RNA-Schalter und einem Riboswitch? Beide haben ja damit zu tun, dass etwas an untranslatierte Bereiche der mRNA bindet und durch die so entstehende Konformationsänderung die Translation/Transkription beeinflusst.

Ist der einzige Unterschied, dass der Riboswitch nur Metabolite bindet und der DNA-Schalter auch andere Co-Faktoren?

Ich werd da aus der Vorlesung nicht so schlau, für mich wirkt es ziemlich wie das selbe.

MfG

Jono

jörg · Anmeldungsdatum: 12.12.2010 Beiträge: 2107 Wohnort: Bückeburg

Ich würde auch sagen, dass man die Begriffe synonym verwenden kann und der Begriff "RNA-Schalter" als gesonderter Terminus war mir bis jetzt unbekannt.
Ich habe gelernt, dass riboswitches sog. "RNA-Schalter" sind. Auch hier werden die Begriffe synonym verwendet:

http://biospektrum.de/blatt/d_bs_pdf&_id=1024863

Da ich aber meist englischsprachige Literatur verwende, kann es auch sein, dass wieder nur die Deutschen hier einen Unterschied machen. Wonach sich die Unterscheidungskriterien allerdings richten, kann ich nicht sagen. Vielleicht werden diejenigen zugrundegelegt, die du genannt hast, vielleicht ist der Begriff der "riboswitches" aber im deutschsprachigen Raum auch Prokaryonten vorbehalten.
Ich stimme dir zu: Einen grossen Unterschied kann es nicht geben, da nach meinem Wissen alle bisher entdeckten Ribozyme, die auf diese Art "arbeiten" über sehr ähnliche Aptamerdomänen verfügen.

JonomcFlono · Anmeldungsdatum: 28.01.2011 Beiträge: 99

Die Frage des Dozenten lautet: "Was verstehen Sie unter einem RNA-Schalter, was unter einem Riboswitch?"

Legt also nahe, dass es einen Unterschied geben soll. Aber wie du schon sagtest, ist in den meisten Quellen keine solche Unterscheidung zu finden.

Deswegen vielen Dank an dich! Ich werde es enfach synonym verwenden und möglicherweise die unterschiedlichen Bindungselemente nennen.