Was ist bei einer DNA-Sequenzanalyse bekannt?

kwongk · Anmeldungsdatum: 05.10.2012 Beiträge: 9

Hallo!

meine Frage bezieht sich auf die DNA-Sequenzanalyse nach Sanger. In vielen Abbildungen wie dieser hier zum Beispiel:

http://www.abiunity.de/attachments/12099.jpg

wird die zu untersuchende DNA immer so dargestellt, als ob die Sequenz immer schon bekannt wäre.

Das Ergebnis der Analyse ist eigentlich die Abfolge der Nuklide herauszubekommen. Eigentlich ein Widerspruch, wenn man es nach der Abbildung schon weiß. Irgendwie mag auch kein Buch, keine Internetseite dazu etwas sagen, wenn meine Frage ist, was am Anfang solch eines Versuches denn bekannt ist.

Weiß man nur die komplementären Nuklide zu den Primern oder doch schon wieder alles, was keinen Sinn ergäbe?

Oder weiß man eigentlich, wenn man sich jetzt auf die Sbbildung bezieht, nur die Sequenzabfolge AGT?

Ich würde mich über eine Antwort freuen.

kwongk

PaGe · Moderator Anmeldungsdatum: 19.03.2007 Beiträge: 3549 Wohnort: Hannover

Man "weiß" man nur die Sequenz, die komplementär zum Primer ist, wobei man da auch vorsichtig sein muss, da ja sogar eine Base mal anders sein könnte, es aber nicht dazu führt, dass der Primer gar nicht mehr bindet.

Die Sequenz muss man dann aus dem Gel ableiten. Bei den Abbildungen ist es dann aber so gewählt, dass man es logisch nachvollziehen kann. Deshalb steht dort die Sequenz. Im Prinzip hast du recht, dass dort erst einmal immer ein Fragezeichen drin stehen müsste.

kwongk · Anmeldungsdatum: 05.10.2012 Beiträge: 9

Verstehe. Vielen Dank!