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Insomnia Gast
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Verfasst am: 24. März 2014 18:56 Titel: Agarosegelelektrophorese |
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Meine Frage:
Bei der Analyse eines neu konstruierten rekombinanten Plasmids wurde eine Agarosegelelektrophorese durchgeführt. Parallel zum kpnl-verdaucten Plasmid wurde uach eine unverdaute Plasmidkontrolle mitgeführt. Nach der färbung des Gels mit Ethidiumbromid und nachfolgender UV-visulalisierung der DNA zeigen sich in der Spur des unverdauten Plasmids zwei Banden, beim kpnl, verdauten hingengen nur eine. Wie erklären sie dieses Ergebnis?
Meine Ideen:
mir fällt folgendes dazu ein:
-unsauberes Arbeiten (eigene DNA im unverdauten Tube)
-Proben vertauscht
-Dimerbildung von irgendwelchen Primern
-Agarosegel war zu großporig
scheint mir aber niemals die richtig Antwort auf die fragen zu sein..... |
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PaGe Moderator
Anmeldungsdatum: 19.03.2007 Beiträge: 3549 Wohnort: Hannover
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Verfasst am: 24. März 2014 20:03 Titel: |
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offenes und supercoil Plasmid? Sahen die Banden den sauber und scharf abgegrenzt aus? _________________ Die deutsche Rechtschreibung ist Freeware, du darfst sie kostenlos nutzen. Aber sie ist nicht Open Source, d. h., du darfst sie nicht verändern oder in veränderter Form veröffentlichen. |
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Insomnia Gast
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Verfasst am: 24. März 2014 20:36 Titel: |
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Ein bild gab es nicht. Es ist eine Frage von meinem Professor in einem Übungsblatt.
du meinst also das lineare bzw supercoil Plasmid im unverdauten tube waren.
warum ist beim verdauten aber nur eine Bande?
Weil das supercoil geschnitten wurde (1x) und ist jetzt genauso schnell/lang wie die linearisierte?
Warum wurde die linearisierte nicht geschnitten? Weil der Bruch genau dort ist, wo das Restriktionsenzym normalerweise ansetzt?
sorry ich steh aufm schlauch |
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PaGe Moderator
Anmeldungsdatum: 19.03.2007 Beiträge: 3549 Wohnort: Hannover
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Verfasst am: 24. März 2014 20:51 Titel: |
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Weshalb das genau so ist, kann ich dir auch nicht sagen, aber ringförmige Plasmide kommen einmal als Ring vor und können sber auch als Supercoil vorliegen. Bei den linerarisierten, geschnittenen Plasmiden beobachtet man das nicht. _________________ Die deutsche Rechtschreibung ist Freeware, du darfst sie kostenlos nutzen. Aber sie ist nicht Open Source, d. h., du darfst sie nicht verändern oder in veränderter Form veröffentlichen. |
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Insomnia Gast
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Verfasst am: 24. März 2014 21:07 Titel: |
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ah okay vielen dank |
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