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Wie 2 Allele eines Organismus vergleichen?
 
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KoKoralle



Anmeldungsdatum: 01.09.2015
Beiträge: 8

BeitragVerfasst am: 14. Sep 2015 15:59    Titel: Wie 2 Allele eines Organismus vergleichen? Antworten mit Zitat

Hallo,
ich soll die Allele des TAS2R38 Rezeptors vergleichen. Es gibt davon 2 Allelformen im Menschen. Ich soll herausfinden welche Form der des Rezeptors im Schimpansen gleicht!

Jedoch bin ich mittlerweile völlig verzweifelt (und aggressiv), da ich nunmal keine Allelvarianten im Menschen finde.
Ich finde eine Sequenz aus dem Menschen und eine vom Affen. Das Alignment funktioniert- alles rosa! Aber ich finde keine verdammte zweite Sequenz, welche für das andere Allel im Menschen stehen soll. Teufel Ansage
Ich weiß, dass es drei Stellen (SNP) im Gen geben soll, die den Unterschied ausmachen. Aber analysieren lässt sich das nicht, wenn man nur eine Sequenzvariante des Gens findet.
Firelion



Anmeldungsdatum: 27.08.2009
Beiträge: 1878

BeitragVerfasst am: 14. Sep 2015 19:26    Titel: Antworten mit Zitat

Hi,

wenn du die jeweilige Base asusrauscht und dann die neue Version alignest sollte es möglich sein. Hier stehen die Varienten:

http://chemse.oxfordjournals.org/content/early/2013/04/30/chemse.bjt016.full

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/5726


LG

_________________
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