Replikationsgeschwindigkeit von E.coli

Hendrik · Anmeldungsdatum: 26.06.2006 Beiträge: 2

Hallo,
habe eine Aufgabe bekommen und würde gerne wissen ob ich mich mit meiner Antwort richtig liege.
Hier die Aufgabe:
"Berechnen Sie die Replikationsgeschwindigkeit in Basen pro Sek. für die DNA von E.coli (4,2 mio. Basenpaare), wenn ein Replikationszyklus 30 min dauert."

Wenn ein Zyklus 30min dauert, bedeutet das doch, das 4,2 mio. Basenpaare in 30min verdoppelt werden. Daraus würde sich dann ergeben:
4,2 mio. / 30 = 140000 Basen pro Min.
140000 / 60 = 2333,33333 (Periode) Basen pro Sek.

Ist meine Rechnung richtig oder hab ich mich irgendwie vertan?

Mit freundlichen Grüßen,
Hendrik

elementum · Ehrenmitglied Anmeldungsdatum: 30.04.2006 Beiträge: 485 Wohnort: HD

wenn die ergebnisse stimmen... aber ich denke du hast mim taschenrechener gerechnet... also müsste das ergebnis stimmen....
du musst nur beachten, dass diese zahl nicht nur für eine polymerase gilt, sondern für alle die gleichzeitig an dem strang synthetisieren.

Hendrik · Anmeldungsdatum: 26.06.2006 Beiträge: 2

Ja, das ist mir bewusst.
Rechnungen mit Taschenrechner gemacht, wollte nur wissen ob ich richtig liege und auch die richtigen Rechnungen gemachen habe.
Danke für deine schnelle Antwort!

Gruß
Hendrik

RayJay · Anmeldungsdatum: 03.07.2006 Beiträge: 8 Wohnort: Bielefeld

Hallo ihr beiden!

elementum · Ehrenmitglied Anmeldungsdatum: 30.04.2006 Beiträge: 485 Wohnort: HD

hmmm... eigentlich schon Big Laugh

da hast du recht^^

RayJay · Anmeldungsdatum: 03.07.2006 Beiträge: 8 Wohnort: Bielefeld

helljoy · Anmeldungsdatum: 13.07.2006 Beiträge: 2

Die Geschwindigkeit der Polymerase lässt sich leider nicht aus der Verdopplungszeit
der Zelle berechnen, sie beträgt keinesfalls über 2000 Nukleotide pro Sekunde
sondern weitaus weniger.

In sich schnell teilenden Zellen wird am einzelnen Replikationsursprung von
E. coli einfach öfter die Replikation initiiert, so erhält man dann auch
partiel diploide Zellen bzw. partiel polyploide Zellen.

Gruß und so,
Helljoy

P.S. steht alles schön im Knippers, oder im Lengeler/Schlegel/Drews.

elementum · Ehrenmitglied Anmeldungsdatum: 30.04.2006 Beiträge: 485 Wohnort: HD

okay, damit magst du streng genommen wohl recht haben, aber die rechnung stimmt (zumindest für die oben genannte aufgabenstellung:
"Berechnen Sie die Replikationsgeschwindigkeit in Basen pro Sek. für die DNA von E.coli (4,2 mio. Basenpaare), wenn ein Replikationszyklus 30 min dauert." )

wenn du eine solche aufgabe bekommst, wird denke ich verlangt mit dem gegebenen zu rechnen. außerdem ist in der aufgabenstellung auf den replikationszyklus der DNA hingewiesen worden, der angeblich 30 mins lang dauert.
Ich denke also, hendrik hat recht Augenzwinkern

trotzdem gu, dass du das hier erwähnt hast

mfg,
elementum

helljoy · Anmeldungsdatum: 13.07.2006 Beiträge: 2

Naja, Replikationsgeschwindigkeit, hmmmm, mal wieder nicht nachgedacht
beim Lesen und mit der Verdopplungszeit verwechselt Hammer

, v.a. weil ich davon
ausging dass E. coli eine Replikationsgeschwindigkeit von ca. 1 h hat (es
scheinen aber in der Tat 33 min zu sein, s. Link).

Anyway, kleiner Zusatz, v.a. damit nicht jemand der hier reinsurft diesen
Wert als Geschwindigkeit der DNA-Polymerase annimmt: wir haben in E. coli
zwar nur einen Replikationsstartpunkt, aber die Replikation verläuft von da
aus in zwei Richtungen, also müssten da eher so um die 1100 Basen pro
Sekunde pro Replikationsgabel sein.
Dumm nur dass der nicht zu der turnover number der Polymerase passt,
der liegt nämlich so bei 150 Basen pro Sekunde.
Muss da nochmal drüber nachdenken.

Gruß und so,
Helli

elementum · Ehrenmitglied Anmeldungsdatum: 30.04.2006 Beiträge: 485 Wohnort: HD

naja, des wird wohl daran liegen, das der strang nicht nur an einer stelle, sondern gleich an mehreren stellen gleichzeitig getrennt, und von dort aus repliziert wird. d.h. dass nicht nur 2 sondern sehr viele DNA-Polymerasen gleichzeitig an einem strang synthetisieren. also kann es schon hinkommen...