Substratspezifität bei Proteinase des Pankreas

KriZzi89 · Anmeldungsdatum: 06.02.2007 Beiträge: 3

Hallo Leute,
ich bin neu hier & hab auch gleich ganze 5 ! schwierige aufgaben, die ich bis Freitag abgeben muss. Hier mal das Arbeitsblatt mit den Aufgaben:

http://i7.tinypic.com/2ccug6e.jpg

Könnt ihr auch die bilder dazu gucken. Ich schreib die Aufgaben nochmal hierher & hoffe ihr könnt mir helfen, ich hab nämlich Null Peilung wie das gehn soll. Wäre froh wenn ihr mir Denkanstöße geben könntet, damit ich es mit eurer Hilfe schaffe das bis donnerstag fertig zu haben. Übrigens haben wir dazu noch NICHTs wirklich gemacht & voll viele haben kein plan wie das geht aus meinem kurs.

Also Aufgabe 1:
Die Protein abbauenden Verdauungsenzyme des Pankreas Trypsin, Chymotripsin und Elastase gehören zu den Endopeptidasen, die die Spaltung von Peptidbindungen durch Hydrolyse innerhalb der Aminosäureketten von Polypeptiden und Proteinen katalysieren. Formulieren und erklären Sie diese Reaktion am Beispiel des Ausschnitts aus einem Proteinmoleküls rechts (siehe Link, vllt seht ihr alles besser wenn ihr euch das bild aufm pc speichert).

Aufgabe 2:
n den Grafiken unten sehen Sie das aktive Zentrum der 3 Verdauungsenzyme mit einem daran gebundenen Substratmolekül. die bindenden Bereciche von Enzym und Substrat sind hellgrau utnterlegt.. Geben Sie an, welche Reaktion das Substrat von den Enzymen katalysiert wird, und erklären Se anhand dieser Beispiele die Begriffe Wirk- und Substratspezifität.

(Also die Substratspezifität im allgemeinen beschreibt ja die Eigenschaft eines Enzyms, die Reaktion einer bestimmten substratgruppe oder eines bestimmen Substrats & von der Wirkspezifität weiß ich dass sie vorliegt wenn von einer Vielzahl von Reaktionen die ein Substrat eingehen kann (oxidation etc als bsp.) nur die von dem entsprechenden Enzym mögliche REaktion katalysiert wird & der rest wird nicht katalysiert)

Aufgabe 3:

Schneiden Sie die Formelbilder links aus. Prüfen Sie durch "einpassen" dieser Modelle in das aktive Zentrum der Enzyme oben, welche der abgebildeten Aminosäuren als Substrate der Verdauungsenzyme infrage kommen könnten.

(Muss ich mir also angucken was von der Form reinpassen würde oder muss ich auf diese bindungen achten? Ich dahcte mir Methionin passt in das Lysin-Substrat, bin mir aber nicht sicher, weils von der form nicht passen würde aber da könnte ja incluced fit vorkommen? bei den restlichen hab ich keine ahnung.)

Aufgabe 4:

Markieren Sie in dem unten abgebildeten Polypeptid die Bindungen, deren Hydrolyse von der Elastase katalysiert wird.

(Ka wie find ich das raus? Sry dass ich so blöd frage aber ich hab da wirklich null ahnung -.-)

Aufgabe 5:

Listen Sie auf welche Spaltrodukte zu erwarten sind,
-wenn jedes der 3 Verdauungsenzyme einzeln auf das Polypeptid einwirkt,
-wenn sie gemeinsam einwirken

Hoffe ihr könnt mir auch da helfen.
Bin dankbar für alles
lg

M!cha · Anmeldungsdatum: 22.12.2006 Beiträge: 52

Ok ich versuchs mal Augenzwinkern

Ich garantiere allerding für nicht, ich mach das rein gefühlsmäßig ^^

1) Wenn die Hydroxygruppe (z.B. des Trypsins) auf die Peptidbindung trifft, dann sorgen die freien Außelektronen des O`s für eine "Abstoßung" der Bindungselektronen zwischen OC-NH. Das Elektronenpaar wird quasi aus der Bahn gedrückt und landet vollständig bei NH (wegen stärkerer EN des Stickstoffs). Was dann mit dem Wasser passiert liegt ja auf der Hand, das überlasse ich dir Augenzwinkern

2)Hm die esrte Frage versteh ich nicht ganz... ?!
Aber Substratspezifität erkärt sich ja durch die unterschiedlichen Bindungsregionen mit unterschiedlichen Zwischenmolekularen bzw elektrostatischen Kräften die zueinander passen müssen: z.B. bei Trypsin Ionenbindung, Chymotrypsin mit H-Brücken und Elastase Van-der-Wals Kräfte
Wirksspez. ist halt, dass nur eine spezielle Reaktion abläuft, hier halt die Hydrolyse

3) schau einfach auf die chemischen Gruppen innerhalb der Substratmoleküle und suche ein passendes Gegenstück im Enzym
Stichworte: Ionenbindung, H-Brücken, V-d-W Kräfte

4) Alles nich so schwer Augenzwinkern

Wenn du dir oben das Bildchen mit der Elastase mal anschaust siehst du, dass nur Alanin als Substrat in Frage kommt. Alle anderen AS passen nicht. Und dann wendest du diesen "Nur-bei-Ala-Schnitt" einfach in der Polypeptidkette an.

5) Genau das selbe wie 4)... Einfach schaun welche AS zum Schnitt führt und wie oft/wo geschnitten wird

Da ich kein Student bin sind alle Angaben wie immer ohne Gewähr! Die Superzahl ist die 9 Augenzwinkern

KriZzi89 · Anmeldungsdatum: 06.02.2007 Beiträge: 3

Hey danke schonmal für deine Hilfe, so eingigermaßen kann ich das auch nachvollziehen (:
Würde mich übere weitere antworten aber dennnoch freuen ;d

blubbi · Gast

voll gut von dir, dass du die aufgaben so leicht erklärt hast, warst meine letzte rettung smile

dankeeeee

.::Antonius18::. · Anmeldungsdatum: 23.01.2010 Beiträge: 1

das ist genau das selbe blatt wie ich auch machen muss vieln dank schon mal, aber an manchen stellen versteh ichs nicht.

Karon · Organisator Anmeldungsdatum: 06.11.2004 Beiträge: 2344 Wohnort: Hessen

Willkommen im Forum, Antonius! Wink

Wenn du noch weitere Hilfe möchtest, solltest du aber etwas konkreter sagen, was du nicht verstehst. Hellsehen können wir nämlich leider noch nicht hier. Zwinkern

illabo_93 · Anmeldungsdatum: 12.01.2011 Beiträge: 2

meine frage zu eins wäre jetzt: was passiert mit dem wasser genau?

jörg · Anmeldungsdatum: 12.12.2010 Beiträge: 2107 Wohnort: Bückeburg

Was denkst du denn?

illabo_93 · Anmeldungsdatum: 12.01.2011 Beiträge: 2

kann es sein, dass sich bei der reaktion ein proton abspaltet und eine carbonsäure entsteht?

jörg · Anmeldungsdatum: 12.12.2010 Beiträge: 2107 Wohnort: Bückeburg

Wo meinst du, spaltet sich ein Proton ab?

Und in welche Klasse gehst du? Ich frage das, um zu erwägen, wie tief wir auf den Mechanismus der Serinproteasen (so heißt die Gruppe der pankreatischen Peptidasen) eingehen sollten....
Reicht es, die Netto- Reaktionsformel zu erarbeiten?

Horst · Gast

aber das sind ja nicht alle Aufgaben zu 100% Lehrer

jörg · Anmeldungsdatum: 12.12.2010 Beiträge: 2107 Wohnort: Bückeburg