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Nachricht |
noobo4
Gast
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 Verfasst am: 03. Jan 2012 08:52 Titel: Mini and Microsatellites |
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Hallo,
ich hab eeien Frage zu den Vor und Nachteilen von Mini und Microstellites beim DNA profiling. Ich habe gelesen, dass Jefferey's ursprünglich Minisatellites verwendet hat die RFLP'S aufwiesen. Nun heisst es, dass an auf dem fertigen blot dann dei einzelnen allelen nicht mehr unterchieden werden könnten weswegen man auf auf eien 'single-locus' methode umgestiegen ist also sich nru einen locus anguckt aber dafür 4 hintereinander (hypervariable), dass aber bei dieser Methode immer noch das 'binning' das Problem war, weswegen man dann auf microsatellites umgestigen ist die auf polyacrimde gel leichter zu unterscheiden sind. Wurden nur letztere per PCR vervielfältigt, weil das in manchen texten so rauskommt, und was ist der genau unterschied zwischen der ursprünglichen technik von Jefferey's und der single locus methode?
vielen Dank |
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jörg
Anmeldungsdatum: 12.12.2010
Beiträge: 2107
Wohnort: Bückeburg
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| Verfasst am: 03. Jan 2012 18:40 Titel: Re: Mini and Microsatellites |
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| noobo4 hat Folgendes geschrieben: | und was ist der genau unterschied zwischen der ursprünglichen technik von Jefferey's und der single locus methode?
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Jeffrey verwendete Multi-locus-Sonden, die also verschiedene Allele detektiert haben. Somit konnte man zwischen den Allelen nicht unterscheiden. Es ist auch nicht bekannt, welche Loci sich hinter einer Bande verbergen, welche Banden gekoppelt vererbt werden und wie die Mutationsraten sich verhalten. Zudem kann eine Bande nicht einer exakten Grösse zugeordnet werden, weswegen man auf "bins" zurückgreifen musste. Man ist also auf mehr oder weniger komplexe Rechenoperationen angewiesen, um die Grössenbestimmungen unter Berücksichtigung der Mutationsraten vorzunehmen.
Der Vorteil ist, dass man nur eine Sonde benötigt.
Bei Einzellocussonden benötigt man für jedes Allel eine eigene Sonde, möchte man also z.B. 7 Allele prüfen, benötigt man 7 Sonden. Das ist etwas aufwändiger, aber auch eindeutiger, da jeder Sonde genau ein Locus zugeordnet werden kann.
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