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Sequencing By Ligation
 
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Firelion



Anmeldungsdatum: 27.08.2009
Beiträge: 1878

BeitragVerfasst am: 17. Nov 2013 13:36    Titel: Sequencing By Ligation Antworten mit Zitat

Hi,

ich habe ein kleines Verständnisproblem bei der Next Generation Sequencing Methode Sequencing By Ligation.


Mir ist soweit klar, dass man hier Dinukleotise nimmt und diese mit einem von vier Fluoreszenzfarbstoffen markiert sind.

Jetzt repräsentiert jede Farbe aber 4 Dinukleotide ( z.B. AA, TT, GG und CC). Woher weiß man welches dieser 4 Dinukleotide jetzt gebunden hat? Auch wenn man jede Base doppelt bestimmt bietet dies ja jedes mal auch 4 Möglichkeiten.


Oder gibt man immer nacheinander 4 Dinukleotide hinzu z.B. AA, AT, AG, AC und schaut was bindet. Dann wüsste man ja, dass das erste Nukleotid auf jeden Fall ein A ist und die Farbe verrät einem was das 2. ist?

Also werden alle 16 Dinukleotide oder immer 4 Dinukleotide gleichzeitig hinzugegeben?


LG und Danke

Firelion

_________________
It is well known that a vital ingredient of success is not knowing that what you’re attempting can’t be done - Terry Pratchett
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