| Autor |
Nachricht |
Aloscita
Anmeldungsdatum: 13.07.2008
Beiträge: 4
|
 Verfasst am: 13. Jul 2008 18:27 Titel: HILFE HILFE PRIMER |
 |
|
Dringend Hilfe:
kann mir jemand dieses Ergebniss helfen zu interprtieren?
Also unter
http://www.bioinformatics.nl/cgi-bin/primer3plus/primer3plus.cgi
die Sequenz
ATGTTACCATTTCTGTTTTTTTCCACCCTATTTTCTTTCATATTTACTGAAGCTCAGAAGCACTATTGGG
TCTGCAACTCATCCGATGCAAGTATTTCATACACCTACTGTGATAAAATGCAATACCCAATTTCAATTAA
TGTTAATCCCTGCATAAAATTGAAGGGATCCAGAGGATTGTTGCACATTTTCTACATTCCAAGGAGAGAT
GTAAAGCAATTATATTTCAATCTCTACATAACTGTCAACTCCATGACTCTTCCAAAGCGCAAAGAAGTTA
TTTGCCGAGGATCTGATGATGATTATTCTTTTTGCAGAGCTCTGAAGGGAGAGACTGTGAATACAACAGT
ATCATTCTCCTTCAAGGGAATAAAATTTTCTAAGGGAAAATACAAATGTGTTGTTGAAGCTATTTCTGGG
AGTCCAGAAGAAATGCTCTTTTGCTTGGAGTTTGACATCATACACCAACCTAATTCAAATTAG
eingeben und pick left und right primer wählen.
Das Ergebniss kann ich nicht ganz interpretieren.
Ich weiß nicht was ein left und ein right primer ist^^...ebenso der rest was wichtig istsad smiley...
WAs ich weiß was "Start: 65 Length: 20 bp Tm: 59.9 °C GC: 50.0 %" bedeutet...beim rest bin ich ratlos...bitte brauche hilfe
danke im vorraus und gruß |
|
 |
PaGe
Moderator
Anmeldungsdatum: 19.03.2007
Beiträge: 3549
Wohnort: Hannover
|
| Verfasst am: 13. Jul 2008 19:39 Titel: |
|
|
|
Schreib doch erst einmal, was du überhaupt machen willst. Ich denke, wenn du das geschrieben hast, weist du auch, wie man weiter vorgehen muss. |
|
|
Aloscita
Anmeldungsdatum: 13.07.2008
Beiträge: 4
|
| Verfasst am: 13. Jul 2008 19:42 Titel: |
|
|
ich will eine ganz normae PCR durchführen und einen geeigneten Primer dazu finden
also mehr kann ich nicht sagen und megr hab ich eigtl. auch nicht vor, also nichts kompliziertes |
|
|
PaGe
Moderator
Anmeldungsdatum: 19.03.2007
Beiträge: 3549
Wohnort: Hannover
|
| Verfasst am: 13. Jul 2008 19:53 Titel: |
|
|
Für eine PCR findest du selten nur einen Primer, sondern brauchst ein Primerpaar.
Du musst wissen, welchen Teil der Sequenz du wirklich brauchst. Wenn es eine Komplettsynthese sein soll, musst du sowieso an den Ende der Sequenz anfangen und den passenden Primer bilden. Mit dem Programm kannst du dann checken, ob der Primer überhaupt geeignet ist oder sich zu schnell wieder ablöst (->Tm).
Bestellt habe ich noch nie welche, daher kann ich dir nicht sagen, wie man die Primersequenz angibt, die man haben möchte. |
|
|
Aloscita
Anmeldungsdatum: 13.07.2008
Beiträge: 4
|
| Verfasst am: 13. Jul 2008 19:54 Titel: |
|
|
okay danke aber jetzt bin ich noch mehr depri^^
für was braucht man denn sonst so ein primer design programm |
|
|
PaGe
Moderator
Anmeldungsdatum: 19.03.2007
Beiträge: 3549
Wohnort: Hannover
|
| Verfasst am: 13. Jul 2008 20:02 Titel: |
|
|
Damit es einem hilft.
Es macht dir ja Vorschläge, welche Primer man benutzen könnte. Ob du diese aber wirklich gebrauchen kannst, hängt davon ab, welchen Teil der Sequenz du benötigst. |
|
|
Aloscita
Anmeldungsdatum: 13.07.2008
Beiträge: 4
|
| Verfasst am: 13. Jul 2008 20:09 Titel: |
|
|
okay also womit ich überhaupt im mom. nicht klar komme ist der begriff left primer^^
beim right primer konnt ich mir das erklären ( möglichts nah am 3'-Ende...repliziert nach links weiter und wird von rechts nach links gelesen)....wie ist das aber mit left??? da macht all dies kein sinn |
|
|
PaGe
Moderator
Anmeldungsdatum: 19.03.2007
Beiträge: 3549
Wohnort: Hannover
|
|
|
Bert
Anmeldungsdatum: 26.09.2007
Beiträge: 82
Wohnort: Niedersachsen
|
| Verfasst am: 14. Jul 2008 16:48 Titel: |
|
|
| Aloscita hat Folgendes geschrieben: | Dringend Hilfe:
bin ich ratlos...bitte brauche hilfe
|
Was willst du machen? Willst etwas (theoretisch) lernen, oder willst du eine PCR im Labor durchführen?
Der Link ist eine DNA-Analyse-Software, mit der du ein Stück DNA-Sequenz und Primer auf Eignung für eine erfolgreiche PCR analysierst. Die Software geht davon aus, daß du bei der Primer-Wahl freie Hand hast und darum spuckt sie einige optimale Primer-Paare, mit denen die PCR „sehr gut klappt“ (in der Praxis ist es selten der Fall, oft muß man nehmen Anfang/Ende, wie sie kommen, und die PCR-Konditionen entsprechend anpassen).
_________________
Holzhacken ist deshalb so beliebt, weil man bei dieser Tätigkeit den Erfolg sofort sieht. [Albert Einstein] |
|
|
|
Registrieren
Login
FAQ
Suchen
