Hilfe bei Western Blot Interpretation, Tay Sachs Disease

chouchouette · Gast

Meine Frage:
Meine Frage betrifft den folgenden Artikel: (Link unten angehängt)

Tay Sachs disease mutations in HEXA target the ? chain of hexosaminidase A to ER-associated degradation
Devin Dersh*?, Yuichiro Iwamoto*, and Yair Argon*

Es geht um Figure 6C. Ich würde gerne wissen, wie die ganzen Banden zu interpretieren sind, vorallem die unteren Banden in allen drei Blots. Vielleicht kann mir jemand erklären, was die mit "fragment" genau meinen. Außerdem frage ich mich warum beim WT mit DMSO noch Banden unter der Hauptbande zu sehen sind, wenn dieser doch nicht deglykosiliert wird.

http://www.molbiolcell.org/content/early/2016/09/26/mbc.E16-01-0012.full.pdf+html

Meine Ideen:
Bisher verstehe ich, dass retrotranslokalisierte Proteine mit Biotin markiert und das eben mit Streptavidin sichtbar gemacht werden kann. Normalerweise werden die zu degradierenden Proteine deglykosyliert, weshalb man in den Mutanten Shifts sieht und beim WT nicht, Z-VAD blockiert dann die PNGase die dafür zuständig ist. MG-132 blockiert den proteasomalen Abbau, weswegen sich die Proteine im Cytosol anhäufen und sichtbar sind.

Es wäre echt toll, wenn mir jemand mit den Details helfen könnte. Danke!!!