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Gast-0-mat
Gast
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 Verfasst am: 05. März 2006 13:51 Titel: DNA-Sequenzierung nach Sanger - Reihenfolge ? |
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Moin.
Also ich habe eine wichtige Frage zur Sequenzierungsmethode nach Sanger.
Gegeben sind ja die gleichen Ansätze mmit dem Unterschied dass es jeweils ddG/ddA/ddC/ddT als Abbruchnukleotide gibt.
Diese werden bei der Neusynthese irgendwann eingebaut udn fürhen zum Abbruch.
Dann werden die 4 Ansätze bei der Gelelektrophorese aufgetrennt und aus der zurückgelegten Entfernung (wann hört das eigentlich auf? Würden die ewig weiterwandern wenn die Spannung anbliebe?) kann man dann (angeblich) direkt die Reihenfolge der Basen erkennen.
Allerdings kann es doch sein, dass jeder der 4 Ansätz sehr weit auseinander liegt !
Dann muss man das ganze sooft wiederholen bis an jeder Stelle mal ein Abbruchnukleotid eingebaut war und die doppelten Einbauten (Informationstechnisch gesehen) außen vor gelassen werden, sonst gäbe es u.U. eine falsche Reihenfolge, oder ?
Und wie lese ich denn das Diagramm der Elektrophorese genau ab ? |
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Karon
Organisator
Anmeldungsdatum: 06.11.2004
Beiträge: 2344
Wohnort: Hessen
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| Verfasst am: 05. März 2006 18:32 Titel: Re: DNA-Sequenzierung nach Sanger - Reihenfolge ? |
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| Gast-0-mat hat Folgendes geschrieben: | | (wann hört das eigentlich auf? Würden die ewig weiterwandern wenn die Spannung anbliebe?) |
Sie würden so lange weiter wandern bis sie an der Elektrode angekommen und somit "aus dem Gel heraus gelaufen" sind.
| Zitat: |
Und wie lese ich denn das Diagramm der Elektrophorese genau ab ? |
Von unten nach oben musst du das Gel ablesen.
_________________
Wie poste ich falsch?
Nachdem ich Google, die FAQs & die Boardsuche erfolgreich ignoriert habe, erstelle ich 2-5 neue Themen in den falschen Unterforen mit kreativem Titel & undeutlichem Text, unter denen sich jeder etwas anderes vorstellen kann. |
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Gast
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| Verfasst am: 05. März 2006 19:33 Titel: Re: DNA-Sequenzierung nach Sanger - Reihenfolge ? |
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| Gast-0-mat hat Folgendes geschrieben: | Allerdings kann es doch sein, dass jeder der 4 Ansätze sehr weit auseinander liegt !
Dann muss man das ganze sooft wiederholen bis an jeder Stelle mal ein Abbruchnukleotid eingebaut war und die doppelten Einbauten (Informationstechnisch gesehen) außen vor gelassen werden, sonst gäbe es u.U. eine falsche Reihenfolge, oder ?
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Und? |
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Triple F
Anmeldungsdatum: 17.11.2005
Beiträge: 31
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| Verfasst am: 09. März 2006 20:59 Titel: |
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Statistisch gesehen ist das so berechnet, dass du für jedes Nukletidposition eine Abbruchreaktion bekommst. Falls eine Teilsequenz nicht ganz eindeutig ist, wird die Sequenzierung wiederholt...
_________________
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