Nicht-,synonyme Substitutionen,positive/negative Selektion

akvi · Gast

Hallo!
Ich habe ein kleines Denkproblem.
Sei Ds die Anzahl der synonymen Substitutionen und Dn die Anzahl nichtsynonymen.

Wenn Dn>Ds - Hinweis auf positive Seketion
Dn<Ds - Hinweis auf negative Selektion

Ich verstehe nicht warum das so ist.

Wenn es mehr synonyme Substitutionen und weniger nichtsynonyme Substitutionen gibt, bedeutet es, dass nur wenige kodierte AS verändert werden, da bei synonymen Substitutionen nicht verändert wird. Warum ist es dann ein Hinweis auf negative Selektion?

Und wenn aber mehrere kodierte AS verändert werden, dann ist es eine positive Selektion.
Je mehr AS verändert werden, desto besser ist es für uns??
Nichsynonyme Substitutionen können aber auch einen negativen Einfluss haben oder?

Vielen Dank im Voraus

Grüße

Firelion · Anmeldungsdatum: 27.08.2009 Beiträge: 1878

Hi,

Bei einer synonymen Substitution oder silent mutation blöeibt die Aminosäure die gleiche. Wenn dies gehäuft auftritt im Vergleich zu missense Mutationen (nicht synonyme) dann würde ich das als Hinweiß darauf deuten, dass die Funktion des unveränderten Proteins wichtig ist. Kommt es zur Missensemutation verliert dieses seine Funktion und das Individuum hat einen Nachteil bezüglich seiner Nachkommen bzw. verstirbt.

Kommt missense häufiger als silent würde ich das als Hinweiß auf die "Verbesserung" des Proteins deuten: Hier haben die Individuuen mit denm neuen Protein plötzlich einen Vorteil (wenn vielleicht auch nur in der einen Situation z.B. hetereozygot für Sichelzellanämie zu sein ist in Malariagebieten von Vorteil) Hier haben dann die Mutationsträger mehr Nachkommen oder bessere Überlebenschancen und daher die die positive Selektion.

So würde ich mir das erklären.

Generell hast du recht damit das missense Mutationen (oder noch schlimmer nonsense)einen negativen Einfluss im Sinne von schlechterer Funktion oder Verlust von Funktion haben können, während silent Mutationen ja nichts an der Funktion verändern. Dennoch können Mutationen auch von Vorteil sein (z.B. die Fähigkeit auch als Erwachsener Laktose zu vertragen).

LG Firelion