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Primer designen
 
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philsim



Anmeldungsdatum: 05.07.2017
Beiträge: 1

BeitragVerfasst am: 05. Jul 2017 12:41    Titel: Primer designen Antworten mit Zitat

Meine Frage:
Ich muss PCR Primer für das Protein P62 designen
Sequenz:
ATGGCGTCGC TCACCGTGAA GGCCTACCTT CTGGGCAAGG AGGACGCGGC
GCGCGAGATT CGCCGCTTCA GCTTCTGCTG CAGCCCCGAG CCTGAGGCGG
AAGCCGAGGC TGCGGCGGGT CCGGGACCCT GCGAGCGGCT GCTGAGCCGG
GTGGCCGCCC TGTTCCCCGC GCTGCGGCCT GGCGGCTTCC AGGCGCACTA
CCGCG ATGAGGACGG GGACTTGGTT GCCTTTTCCA GTGACGAGGA ATTGACAATG
GCCATGTCCT ACGTGAAGGA TGACATCTTC CGAATCTACA TTAAAGAGAA
AAAAGAGTGC CGGCGGGACC ACCGCCCACC GTGTGCTCAG GAGGCGCCCC
GCAACATGGT GCACCCCAAT GTGATCTGCG ATGGCTGCAA TGGGCCTGTG
GTAGGAACCC GCTACAAGTG CAGCGTCTGC CCAGACTACG ACTTGTGTAG
CGTCTGCGAG GGAAAGGGCT TGCACCGGGG GCACACCAAG CTCGCATTCC
CCAGCCCCTT CGGGCACCTG TCTGAGGGCT TCTCGCACAG CCGCTGGCTC
CGGAAGGTGA AACACGGACA CTTCGGGTGG CCAGGATGGG AAATGGGTCC
ACCAGGAAAC TGGAGCCCAC GTCCTCCTCG TGCAGGGGAG GCCCGCCCTG
GCCCCACGGC AGAATCAGCT TCTGGTCCAT CGGAGGATCC GAGTGTGAAT
TTCCTGAAGA ACGTTGGGGA GAGTGTGGCA GCTGCCCTTA GCCCTCTGGG
CATTGAAGTT GATATCGATG TGGAGCACGG AGGGAAAAGA AGCCGCCTGA
CCCCCGTCTC TCCAGAGAGT TCCAGCACAG AGGAGAAGAG CAGCTCACAG
CCAAGCAGCT GCTGCTCTGA TCCCAGCAAG CCGGGTGGGA ATGTTGAGGG
CGCCACGCAG TCTCTGGCGG AGCAGATGAG AAAGATCGCC TTGGAGTCCG
AGGGGCGCCC TGAGGAACAG ATGGAGTCGG ATAACTGTTC AGGAGGAGAT
GATGACTGGA CCCATCTGTC TTCAAAAGAA GTGGACCCGT CTACAGGTGA
ACTCCAGTCC CTACAGATGC CAGAATCCGA AGGGCCAAGC TCTCTGGACC
CCTCCCAGGA GGGACCCACA GGGCTGAAGG AAGCTGCCTT GTACCCACAT
CTCCCGCCAG AGGCTGACCC GCGGCTGATT GAGTCCCTCT CCCAGATGCT
GTCCATGGGC TTCTCTGATG AAGGCGGCTG GCTCACCAGG CTCCTGCAGA
CCAAGAACTA TGACATCGGA GCGGCTCTGG ACACCATCCA GTATTCAAAG
CATCCCCCGC CGTTGTAG

Die zu verwendenden Enzyme für die spätere Klonierung: XhoI und KpnI




Meine Ideen:
Die Multiple cloning site befindet sich hinter dem Tag. Daher muss nach dem zu inserierenden Protein ein Stopp Codon folgen.
Forward: ctcgag (XhoI) gccacc (Kozak) ATGGCGTCGCTCACCGTGAA
Reverse: ggtacc (KpnI) CTA (stopp) CAACGGCGGGGGATGCTT

Bin mir nicht ganz sicher ob das so stimmt.
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