Facharbeit: Oligonukleotide - ...

Andi · Anmeldungsdatum: 14.11.2006 Beiträge: 124 Wohnort: NRW

Hallo zusammen, die Zeit der Facharbeit ist für mich gekommen, und zusammen mit meinem Lehrer habe ich folgendes Thema formuliert:

Oligonukleotide - Wie werden sie hergestellt und welche Rolle spielen sie in der pharmazeutischen Forschung.

In meiner Nähe (Bensberg - NRW) gibt es eine Firma, die Oligonukleotide herstellt und weltweit verschickt (Girindus AG), deswegen dachte ich, dass dieses Thema recht gut ist, da ich so einen praktischen Teil, wzB ein Interview. Zudem haben wir die Polymerase-Ketten-Reaktion, bei der die O-Nukleotide gebraucht werden, schon besprochen.

Nun wollte ich in die Runde fragen, ob jemand von euch schon einmal von der Girindus AG in diesem Zusammenhang gehört hat oder mir Tipps zu Fachliteratur über alles, was mit Oligonukleotiden zu tun hat, geben kann.

Ich wäre euch sehr dankbar smile

lg
Andi

Andi · Anmeldungsdatum: 14.11.2006 Beiträge: 124 Wohnort: NRW

So, mitlerweile habe ich einiges an fachliteratur gesammelt.
Nun stellen sich mir einige fragen:

Was ist Antisense?
Ich habe ein bisschen rumgeforscht und hab es mir zum schluss so erklärt:

passend zu einem mRNA-Molekül wird ein aRNA-Molekül hergestellt (in dem Falle ein Oligonukleotid), welches komplementär zur mRNA ist.
Dieses setzt sich an die mRNA an (passiert das automatisch durch enzyme, oder muss dabei irgendetwas bestimmtes beachtet werden?) sodass diese nicht mehr translatiert werden kann.

noch eine Frage:
Was passiert denn dann danach mit der mRNA, wird die von Enzymen zerschnitten und irgendwie wiederverwertet oder hat sie einen anderen zweck?

und noch eine smile

:
Warum macht man das, es wird doch weiterhin mRNA transscribiert.
wäre es nicht sinnvoller, das Operon für diesen Bereich mit Restriktionsenzymen herauszuschneiden? :/

Ich hoffe, ihr könnt mir da ein bisschen Licht ins dunkle bringen

lg
Andi Wink

revilo · Anmeldungsdatum: 13.12.2007 Beiträge: 79

Das Feld, das du da bearbeitest in unendlich ...
vielleicht helfen ein Stichwort, die du mal nachschlagen kannst.
Das Verfahren, das du da beschreibst nennt sich RNA-Interferenz, unter diesem Stichwort müsstest du die eine oder andere Antwort finden.

Achso, dass Prinzip, mit dem die antisense-mRNA bindet müsstest du aus der Molekularbiologie kennen ... es ist immer das gleiche: Paarung der komplementären Basen (wie bei der DNA-Doppelhelix, der RNA-Transkrition anhand des codogenen DNA-Strangs etc.)

Zu den Restriktionsenzymen ...
Versuche mal zu erklären, wie das Verfahren, das du da vorschlägst funktionieren soll ? ... Es funktioniert nämlich nicht: Wie bekommst du das Restriktionsenzym in die Zelle ? (RNA-Interferenz findet in der lebenden Zelle statt) Wie stellst du sicher, dass das Retriktionsenzym nur an der vorbestimmten Stelle schneidet und nicht die gesamte DNA zerlegt ???

Andi · Anmeldungsdatum: 14.11.2006 Beiträge: 124 Wohnort: NRW

Ok, danke für die korrektur.

war meine Erklärung denn ansonsten richtig?

Und danke für das Stichwort.
Hab ein bisschen damit gegoogelt und schon ein paar gute seiten gefunden.

revilo · Anmeldungsdatum: 13.12.2007 Beiträge: 79

Die RNA-Interferenz ist eine Methode, die Expression auf mRNA Ebene sequenzspezifisch herunter zu regeln und so Genfunktionen aufzuklären. Die Methode beruht auf der Spaltung von dsRNA zu 21-25 nt langen Fragmenten, die jeweils am 3'-Ende 2 Nukleotide langen Überhang besitzen. Diese Fragmente werden als small interfering RNA (siRNA) bezeichnet. Die Spaltung erfolgt über das Enzym DICER, eine RNase III ähnliche Nuklease. Anschließend kommt es zum Entwinden der siRNA Fragmente am sogenannten RISC-Komplex (RNA-induced silencing complex). Nach Anlagern des Antisense Strangs an die Ziel mRNA, kommt es zur Spaltung und damit zum gezielten Abbau der mRNA durch den RISC-Komplex.

Andi · Anmeldungsdatum: 14.11.2006 Beiträge: 124 Wohnort: NRW

ich hab meine Facharbeit endlich fertiggestellt.
Noch ein paar kleine Schliffe und nächste Woche wird abgegeben.

Vielen Dank für alle, die mir geholfen haben, sowohl hier, als auch in der Fragesammlung.