Gentechnologie Gelelektrophorese

Doridori · Anmeldungsdatum: 18.02.2009 Beiträge: 18

Hallo

Ich habe hier eine Aufgabe, wo man zu einem Einzelstrang mit Abbruchnukleotiden einen komplementaären Strang geschaffen hat. Das heißt der 2. Strang ist unterschiedlich lang, je nachdem wo das Abbruchnukleotid eingefügt wird.
Diese unterschiedlich langen Fragmente hat man in der Gelelektrophorese getrennt. Die Fragmente laufen logischerweise alle zum +-Pol.

Meine Frage wäre hier in welche Richtung ich lesen muss, damit ich aus der Gelektrophorese die Basensequenz herauskriege?

In der Lösung steht man liest vom + Pol zum - Pol.Am + Pol fängt das 5' Ende der DNA an.

Woher weiß ich aber ohne in die Lösung zu schauen, ob das 5' Ende am + Pol ist? ISt das immer so?

Liebe Grüße

chefin · Organisator Anmeldungsdatum: 28.04.2004 Beiträge: 1549 Wohnort: Oberhausen

Die Lesrichtung ist immer die gleiche.

Flip · Anmeldungsdatum: 19.03.2009 Beiträge: 13 Wohnort: Gelsenkirchen

Mit Leserichtung meint man doch die Banden und nicht die Leserichtung der verschiedenen DNA-Fragmente!!?
Außerdem wie will man denn anhand der Gelelektrophorese die Basensequenzen herausfinden?
Die Methode der Gelelektrophorese dient doch zur Bestimmung des genetischen Fingerabdrucks!

Ich glaube du hast da was falsch verstanden^^

Doridori · Anmeldungsdatum: 18.02.2009 Beiträge: 18

naja schaut her Augenzwinkern

Zunäcst habe ich einen Einzelstrang gegeben von 3 nach 5.
Zu dem wird hier ein komplementärer Strang gebildet, wobei es 4 Ansätze gibt und 4 Abbruchnukleotide einemal ist A, einmal T, einmal G und C Abbruchnukleotid.
So entstehen von 4 Ansätzen verschieden lange Fragmente, je nachdem wo der Abbruch stattfand. Hier steht auch: "DIe vier verschiedenen Ansätze, in denen jeweils verschieden lange Abruchstränge enthalten sind, werdem im Anschluss gelelektropphoresisch nebeneinander aufgetrennt".

Unten ist dann nebeneinander GATC gegeben (Je nachdem bei "G" war G* Abbruchnukleotid) und über den Basen sind die Banden.

In der Lösung fängt er einfach an vom+ Pol aus abszulesen: erste bande ist über dem A, zweite über dem T, dritte über C, Also fängt ie DNA-Basensequenz am anfang: ATC

bis dahin ist mir ales klar, später soll man anhand der Basensequenz mit der Code Sonne die AS-Sequenz ermitteln. Um das zu tun, muss ich aber wissen, was für ein Strang das ist, das ich da vonm + Pol aus ablesen kann? der codogene von 3 nach 5 oder der code von 5 nach 3?

Im Ergebnis steht dann, dass es sich um den von 5 nach 3 handelt. Man also nochmal den codogenen Bilden muss, dann erst mRNA, dann Aminosäuresequenz.

Aber wieso das nun der code-Strang ist, steht hier nicht. Kann man dann davon ausgehen, dass es immer der Code Strang ist? Oder ist das glückssache wie ich das finde? Oder ist es der Code strang weil hier gaanz am Anfang der komplementäre Strang zu einer Basensequenz ermittelt wird die sowieso von 3 nach 5 geht. Folglich muss ja der komplementäre von 5 nach 3 sein.

DAnn ist das Problem aber: Fange ich GRUNDSÄTZLICH immer beim + Pol an zu lesen? Und versuch irgendwie herauszukriegen welcher Strnag das ist, oder könnte sich das auch mla ändern und man finge vom - Pol aus an?

Sorry für die doofe Beschreibung.