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henef
Anmeldungsdatum: 08.09.2013
Beiträge: 2
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 Verfasst am: 08. Sep 2013 15:55 Titel: Epigenetik: trithorax, polycomb Proteine, kleine RNAs |
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Hallo,
vorweg sry für die wenig differenzierte Überschrift, ich wusste allerdings nicht wie ich es prägnant, kurz formulieren sollte.
Ich habe eine Verständnisfrage, wobei es um folgenden Abschnitt einer Doktorarbeit geht.
"Die epigenetische Genregulation wird über verschiedene Mechanismen gesteuert wie zum Beispiel die DNA Methylierung und die Histon-Modifizierung, aber auch mit Hilfe von kleinen nicht kodierenden RNAs und Proteinen der Polycomb- und Trithorax Familie, welche die Chromatinkondensation beeinflussen können."
Meine Frage dreht sich um den letzten Teil dieses Satzes.
Sind mit "kleinen nicht kodierenden RNAs" die microRNAs gemeint, die Teil des Gen silencing (RNA Interferenz?) sind?
Allgemein fällt es mir schwer das gen silencing einzuordnen.
Wenn man mit der DNA-Methylierung, Histon-Modifikationen und dem Chromatin Remodeling als die 3 Hauptmechanismen der Epigenetik beschreibt, sind Vorgänge wie das Gen-Silencing dann übergeordnete Begriffe die eben durch die epigenetischen Veränderungen auf Molekülebene vorkommen?
Sind mit den "Proteinen der Polycomb und Trithorax Familie", die Proteine der CRM`s gemeint? Also Bestandteil des Chromatin Remodelings?
Falls nicht, wäre ich für ein Schlagwort dankbar, dass ich Gogglen könnte =).
Vorweg danke ich für Eure Antworten und ich hoffe meine Fragen waren halbwegs verständlich. |
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jörg
Anmeldungsdatum: 12.12.2010
Beiträge: 2107
Wohnort: Bückeburg
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| Verfasst am: 09. Sep 2013 13:21 Titel: Re: Epigenetik: trithorax, polycomb Proteine, kleine RNAs |
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| henef hat Folgendes geschrieben: | | Sind mit "kleinen nicht kodierenden RNAs" die microRNAs gemeint, die Teil des Gen silencing (RNA Interferenz?) sind? |
Nein. RNA Interferenz (RNAi) bezeichnet ein posttranskriptionelles Phänomen, also das "Zielgen" muss erst einmal transkribiert worden sein, damit RNAi stattfinden kann. Es gibt noch eine Menge anderer nicht kodierender RNAs. Hier sind aber solche gemeint, die z.B. an ein Chromosom binden und dadurch die Transkription einiger Gene oder gar fast aller Gene dieses Chromosoms verhindern. Das wohl populärste Beispiel ist die Inaktivierung eines X-Chromosoms bei Frauen durch die Bindung einer nicht-kodierenden RNA im sog. "X-Inactivation center". Danach werden nur noch wenioge Gene dieses inaktivierten X-Chromosoms exprimiert, darunter dasjenige, welches für die inaktivierende RNA kodiert.
| henef hat Folgendes geschrieben: | | Sind mit den "Proteinen der Polycomb und Trithorax Familie", die Proteine der CRM`s gemeint? Also Bestandteil des Chromatin Remodelings? |
Ich kenne nur CRMs, die an Transportvorgängen beteiligt sind, wie z.B. der Proteinexport aus oder in den Nukleus. Aber das Stichwort "Chromatin remodeling" passt.
Die Trithorax-Familie lässt sich in drei gruppen einteilen:
(1) Histon-Modifikation
(2) DNA-Bindung und
(3) Chromatin-remodeling.
Die Polycomb-Proteine sind DNA-bindende Proteine mit sog. Zinc-Finger-Domänen.
Beide Gruppen spielen eine Rolle in der Differenzierung von Zellen, indem sie die Gene für "Masterregulatoren" der Zelldifferenzierung (z.B. HOX-Gene oder andere sog. homebox-Gene) epigenetisch markieren und darüber ihre Expression regulieren.
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RNA?- just another nucleic acid? |
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henef
Anmeldungsdatum: 08.09.2013
Beiträge: 2
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| Verfasst am: 09. Sep 2013 17:59 Titel: |
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Danke für die Antwort.
Hatte die RNAi jetzt auch weiter "hinten" in der Proteinbiosynthese angeordnet, nachdem ich mir das Mello/Fire Nobelpreis-Experiment durchgelesen hatte.
Wusste bisher aber noch nicht wohin ich die X-Inaktivierung packen soll.
Find es in der Epigenetik (vllt wegen der Aktualität) nicht immer einfach die ganzen Begriffe und Voränge einzuordnen. |
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